没有考虑作业的品质差异
利用作业来分配人工费的情况下，一般来说都是以时间作为分配基准，但是如果员工之间的作业品质差异过大，那么单纯以时间作为分配基准就有问题。
像工厂劳动者和餐饮店员工这样的情况，不同员工在单位时间之内的生产效率可能差距不大。但像广告代理和研究开发之类的工作，单位时间内工作的质和量则可能出现很大的差距，如果都按照同样的1小时为基准对成本进行管理是不妥当的。
因为ABC本来是从制造业现场的成本管理中发展起来的方法，所以在生产现场能够发挥出强大的作用，但在生产性参差不齐的行业中则难以起到同样的效果。
不只ABC，管理会计的任何工具都有这样一个共同点，那就是在某些领域效果极佳，但在另外一些领域则效果不佳。所以在进行分析时必须注意这一点。
另外，人们在认识到ABC的缺点后，近年来也对其进行了诸多改良。有兴趣的读者可以找一些最近的论文来看一看。